ラムサール登録湿地に認定（1993年）された厚岸湖及び別寒辺牛湿原において、水鳥をはじめとする動植物と湿地の保全や湿原利用に関するＰＲ活動や調査研究・モニタリング等を行う拠点施設（情報センター）です。

１階は展示室・レクチャールームなどがあり、観察カメラが捉えた湿原の映像を大画面モニタで見られるほか、湿原の全容についての写真や解説パネル、立体模型などが展示されています。

２階は観察コーナーになっており、別寒辺牛川河口付近の雄大な湿原の景観を間近に観ることができます。

特に観察カメラは、観察館の建物から約 0.8km離れた山の上（海抜約50m)に遠隔操作のリモコンカメラを設置（水平角度270度・上下角度90度・最大倍率66 倍ズーム）し、別寒辺牛川河口から厚岸湖を見渡せるようにしており、映像は光ケーブルで観察館に配信され、65 インチの大型プラズマビジョンに映し出され、タンチョウの抱卵から子育ての様子、アオサギ・カモ・オオハクチョウ・オジロワシ・オオワシなどの珍しい行動を観察することができるそうです。

また、観察館前の湿原は「タンチョウの縄張り」になっているそうで、春のタンチョウの巣作りから12月までの子育ての様子を観察できるそうですよ。

開館は、4～10月は8:45～17:00・休館日は月曜日（月曜日が祝祭日の場合は開館し、翌火曜日は休館）・祝祭日の翌日・年末年始です。